A 72 évesen elhunyt Cser Miklós zenészcsaládban született, édesanyja, Cser Tímea az Operaház magánénekese volt.
A Zeneakadémián 1975-ben Kórodi András növendékeként diplomázott. Operaházi pályafutását korrepetitorként kezdte, majd a Szegedi Nemzeti Színház tagja lett. 1978-tól Irakban működött, 1980-ban Pál Tamás hívására visszaszerződött Szegedre, ahol a következő évtizedben vezető karmesterként tevékenykedett. Az Operaházban 1987 januárjában Az álarcosbál karmestereként mutatkozott be. A sikeres próbavezénylés után Petrovics Emil szerződtette Cser Miklóst, aki 2001-ig maradt a pesti színház tagja.
Az Operaházban több mint kétszáz előadást vezényelt, a repertoár-produkciók mellett olyan premierek fűződek a nevéhez, mint: az Otello (1988), A bolygó hollandi (1988), a Bánk bán (1993), a Parasztbecsület–Bajazzók (1995), A bahcsiszeráji szökőkút és a Don Quijote (1997). 2000-től a Pécsi Nemzeti Színház zeneigazgatójaként folytatta tevékenységét, 2004-től további hat évig vezető karmesterként dolgozott.
Cser Miklósban Cser Krisztián magánénekes és Cser Ádám karmester édesapját gyászolja.